1. Hóa đơn thay thế/điều chỉnh kê khai vào kỳ nào?
Căn cứ khoản 13, điều 1, Nghị định 70/2025/NĐ-CP sửa đổi bổ sung điều 19 Nghị định 123/2020/NĐ-CP như sau:
d) Hóa đơn điều chỉnh, hóa đơn thay thế đối với trường hợp quy định tại điểm b khoản 1 Điều này thì người bán, người mua khai bổ sung vào kỳ phát sinh hóa đơn bị điều chỉnh, bị thay thế;
đ) Hóa đơn điều chỉnh đối với trường hợp quy định tại khoản 4 Điều này thì người bán kê khai vào kỳ phát sinh hóa đơn điều chỉnh, người mua kê khai vào kỳ nhận được hóa đơn điều chỉnh.”
Như vậy, hóa đơn thay thế hoặc điều chỉnh được kê khai vào kỳ phát sinh hóa đơn điều chỉnh hoặc thay thế. Đối với các trường hợp đặc biệt (Hoàn phí, chiết khấu, trả lại hàng hóa, dịch vụ…) thì người bán kê khai vào kỳ phát sinh hóa đơn điều chỉnh, người mua kê khai điều chỉnh vào kỳ nhận được hóa đơn điều chỉnh/thay thế.
Bên cạnh đó khoản 1 Điều 47 Luật Quản lý thuế 2019 được sửa đổi bởi Điểm a Khoản 6 Điều 6 Luật sửa đổi Luật Chứng khoán, Luật Kế toán, Luật Kiểm toán độc lập, Luật Ngân sách Nhà nước, Luật Quản lý, sử dụng tài sản công, Luật Quản lý thuế, Luật Thuế thu nhập cá nhân, Luật Dự trữ quốc gia, Luật Xử lý vi phạm hành chính 2024 có hiệu lực từ ngày 01/01/2025 có quy định:
1. Người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai, sót thì được khai bổ sung hồ sơ khai thuế trong thời hạn 10 năm kể từ ngày hết thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế có sai, sót trong trường hợp sau đây:
a) Trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định thanh tra, kiểm tra;
b) Hồ sơ không thuộc phạm vi, thời kỳ thanh tra, kiểm tra thuế nêu tại quyết định thanh tra, kiểm tra thuế.
Đối với những nội dung thuộc phạm vi thanh tra, kiểm tra, người nộp thuế được bổ sung hồ sơ giải trình theo quy định của pháp luật về thuế, pháp luật về thanh tra và các trường hợp thực hiện theo kết luận, quy định của cơ quan chuyên ngành có thẩm quyền liên quan đến nội dung xác định nghĩa vụ thuế của người nộp thuế.
Do vậy, khi lập hóa đơn thay thế hoặc hóa đơn điều chỉnh cho hóa đơn có sai sót sẽ làm thay đổi nghĩa vụ thuế GTGT đã thực hiện kê khai trước đó. Trong trường hợp này, doanh nghiệp cần phải lập tờ khai thuế GTGT bổ sung cho tháng (quý) có hóa đơn bị sai sót.
Hóa đơn thay thế hoặc hóa đơn điều chỉnh và hóa đơn bị thay thế/bị điều chỉnh phát sinh tại hai kỳ kê khác nhau thì doanh nghiệp phải thực hiện kê khai hóa đơn thay thế/hóa đơn điều chỉnh trên tờ khai bổ sung của kỳ phát sinh hóa đơn bị thay thế/hóa đơn bị điều chỉnh.
2. Cách kê khai hóa đơn thay thế/điều chỉnh khác kỳ như thế nào?
Trường hợp phát sinh hóa đơn thay thế/hóa đơn điều chỉnh, doanh nghiệp cần xác định sai sót cũng như mức độ ảnh hưởng của việc lập hóa đơn thay thế/hóa đơn điều chỉnh đối với nghĩa vụ thuế của kỳ gốc và thực hiện kê khai theo hướng dẫn sau:
| Sai sót | Chỉ tiêu tờ khai | Thủ tục |
| Sai sót của việc lập hóa đơn thay thế/hóa đơn điều chỉnh không làm ảnh hưởng đến tiền thuế phải nộp, tiền thuế được khấu trừ | Sai chỉ tiêu [23]: Giá trị hàng hóa mua vào[29],[30],[32],[32a]: Doanh thu hàng hóa, dịch vụ bán ra chịu thuế suất GTGT 0%; Doanh thu hàng hóa dịch vụ bán ra chịu thuế suất GTGT 5%; Doanh thu hàng hóa dịch vụ bán ra chịu thuế suất GTGT 10%; Doanh thu hàng hóa dịch vụ bán ra không tính thuế | Không phải nộp Tờ khai bổ sung. DN chỉ cần nộp bản giải trình khai bổ sung và các tài liệu có liên quan. |
| Trường hợp ảnh hưởng của khai bổ sung dẫn đến tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế đã được hoàn của kỳ gốc | Sai sót làm tăng, giảm chỉ tiêu [40] “KHBS” | Lập Tờ khai bổ sung, bản giải trình:Tại tờ khai của kỳ bị sai:
Phải nộp đủ số tiền thuế thiếu và tiền chậm nộp. Nếu chỉ tiêu [40] “KHBS” <0: Theo dõi bù trừ với thuế phải nộp kỳ sau. |
| Nếu ảnh hưởng của khai bổ sung chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau của kỳ gốc | Sai sót chỉ làm ảnh hưởng tăng, giảm chỉ tiêu [43] | Lập Tờ khai bổ sung, Bản giải trình:
Tại tờ khai của kỳ bị sai:
Trên tờ khai của kỳ phát hiện:
|
Lưu ý: Doanh nghiệp cần đảm bảo chỉ tiêu [22] kỳ này bằng chỉ tiêu [43] của tờ khai chính thức kỳ trước liên kề mà không điều chỉnh lũy kế các tờ khai.

